Целью деятельности Департамента является эффективная аграрная политика на территории Томской области.

Задачами Департамента являются:
содействие устойчивому развитию сельских территорий Томской области;
способствование повышению конкурентоспособности агропромышленного комплекса;
стимулирование развития малых форм хозяйствования на территории Томской области.